三平寺第三进塔殿是三平祖师藏骨的所在地。殿基比祖殿高出两米有余，两侧各有台阶，可以从边门通往殿堂。殿为正方形，面积200平方米。殿正中屋顶为八卦斗拱相连，围成一藻井，结构十分精巧，称“蜘蛛结网”。殿中间有一座石龛，三平祖师的法相，高大如人，僧帽袈裟，结跏跌坐龛内，两目低垂，端庄慈祥。两旁侍立蛇、虎二侍者。据传，石龛下有一井，井上摆一大缸，三平祖师的肉身即镇坐在中间。塔殿后墙正中，供奉着唐宣宗敕封义中为“广济祖师”的圣旨牌。

    塔殿的香火很旺，香客非进不可。殿中有卜事签供香客抽签问卜。三平寺卜事签跟药签一样，都是七十五首。

塔殿供奉的神祗还有石巩慧藏禅师、潘荣尚书、颜颐仲尚书。

    一般禅宗寺院的祖殿供奉禅宗初祖达摩禅师及禅宗六祖慧能禅师，而三平寺却是在塔殿左右角供奉石巩慧藏禅师。石巩雕像是后人请入的。石巩禅师是三平祖师的师父，据《五灯会元》记载，当年，祖师到抚州拜谒石巩时，一见面，石巩张弓搭箭，对祖师大喝一声：“看箭！”祖师见此，毫无惧色，用双手擘开衣襟，挺胸挡箭，说道：“此是杀人箭、活人箭？又作么生？”石巩用手弹弓弦三下，叹道：“三十年张弓搭箭，只射得半个圣人。”这也就是三平祖师被称为“半个圣人”的由来。

    潘颜二尚书的塑像供在塔殿右后角，左为颜颐仲、右为潘荣。