解放后，航运业继续发展。1953年，货物运输量4.1万吨，货物周转量13.4万吨公里。小溪港有木帆船321只，1605吨位；南胜港有木帆船35只，175吨位；坂仔港有木帆船46只，230吨位。是年，300只民船参加支前，运送粮食1260万公斤到漳州。船工黄平常、阮来文、黄音（女）3人在支前运输中遭土匪袭击，光荣牺牲，县人民政府追认其为烈士。1953年初，成立琯溪船运站。1956年成立木帆船运输社，货运量3.8万吨，货物周转量11.2万吨公里。1959年货运量4.5万吨，货物周转量10.5万吨公里。1960年至1962年，因自然灾害影响，货运量减少一半。1964年，为支援农业，开展优质服务活动，优先运载肥料，运费八折优待。还为农民从龙海运回砖瓦，做到代采购，代办理托运，不收手续费，深受农民欢迎。1965年货物运输量3.5万吨，货物周转量19.3万吨公里。“文化大革命”期间，航运业不景气，先后有100多户船民上山下乡务农。留下继续航运的100多只船，由于小溪至平寨河道淤塞，迁移至花山溪下游平寨点营运。1974年起，主要为粮食部门载运粮食往漳州、厦门、晋江等地。1979年14只木帆船改用12匹柴油机作动力，提高运输能力，1978年货运量5.8万吨，货物周转量178.96万吨公里。1979年、1980年的货运量分别达6万多吨，创历史最好水平。航管站连续多次被总站评为“工业学大庆”先进集体。